津水师赶到南京，加固水城，起到了安定人心的作用，立甲子三等功，加封天津海防总督，太子少保。
京师禁军三大总兵吴启华、常世隆、胡海龙，从周经武南下与杭州叛军作战，是第一支投入平乱的官兵，同样立下不少功劳。
三人按功勋高低，分别加封为卫指挥佥事，卫指挥使和卫指挥同知。
京师禁军六名坐营官表现同样突出，李逍遥更是激斩叛军千总一员，添立丙例一等功，被总兵吴启华点名提功。
兵部议定，升授李逍遥为禁军千总，统带两名坐营官，部下近一千禁军。
除此之外，南京京营虽然糜烂，却同样有人表现突出，京营提督官郭尚友，虽是文士出身，杭州乱起之时，却投笔从戎，杀贼两人，立有功勋。
南京京营两名千总与几名百总在作战中异常奋勇，堪为典范，对待这些人，崇祯皇帝各自均有封赏。
大典的最后阶段，主要是进行战后得失统计和阵亡、杀敌汇总。
第一场战争，是明清之间一场堪称转折点的战斗，虽然在自家地盘，但却缴获了无数清军的精锐衣甲、辎重和旗牌，甚至三门红夷大炮也被多尔衮扔下，来不及带走。
除此之外，清军沿途劫掠所得，半数多都扔在了三屯营之外，他们撤退匆忙，实际上是被崇祯皇帝亲自率领的明军内外夹击而击溃，自然无法携带太多物资。
这些牛羊和人口，都已经被崇祯皇帝妥善安置，但清军沿途皆被其三光，百姓因此流离失所，死难者甚重。
据倪元璐上疏称，算上兵士升赏，这事后抚恤花费是一笔巨款，可以说有得有失，但这场战斗胜利的意义远比得失重要，崇祯可以说是自己赚到了。
可接下来这场旷日持久的诸王之乱，从最起初东林余孽拥戴朱常淓称帝开始，一直到黄得功平定最后一个称帝的庆王凯旋回到南京城之后，持续了足有半年多的时间。
虽然崇祯皇帝借助战胜清虏之威，迅速扫除了各地羽翼未丰的叛军，但是从根本上来说，大明朝廷却是空有损耗，毫无所得。
半年多的时间，叛军几乎席卷了整个东南，江南的不少州府同样惨遭劫掠，官军获得大体胜利，但是叛军也同样在攻城略地。
这场战争只有无尽的内耗，没有胜者。
虽然平定了内乱，但是崇祯皇帝觉得是自己一败涂地，因为这两场战争下来，尤其是第二场，对大明朝的影响不亚于万历三大征，崇祯已经无力再去管那些流贼了。
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